Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy4Q3TYX8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rufy4Q3TYX8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy4Q3TYX8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy4Q3TYX8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rufy4Q3TYX8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms