Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hhla1Q3TYV2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hhla1Q3TYV2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hhla1Q3TYV2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hhla1Q3TYV2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hhla1Q3TYV2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hhla1Q3TYV2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hhla1Q3TYV2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hhla1Q3TYV2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hhla1Q3TYV2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hhla1Q3TYV2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hhla1Q3TYV2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hhla1Q3TYV2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hhla1Q3TYV2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hhla1Q3TYV2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hhla1Q3TYV2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hhla1Q3TYV2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hhla1Q3TYV2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hhla1Q3TYV2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hhla1Q3TYV2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hhla1Q3TYV2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hhla1Q3TYV2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hhla1Q3TYV2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hhla1Q3TYV2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms