Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a5Q3TYU2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a5Q3TYU2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a5Q3TYU2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a5Q3TYU2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms