Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Ccdc136Q3TVA9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Ccdc136Q3TVA9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ccdc136Q3TVA9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ccdc136Q3TVA9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ccdc136Q3TVA9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Ccdc136Q3TVA9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
Ccdc136Q3TVA9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
Ccdc136Q3TVA9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Ccdc136Q3TVA9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Ccdc136Q3TVA9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ccdc136Q3TVA9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ccdc136Q3TVA9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Ccdc136Q3TVA9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Ccdc136Q3TVA9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
Ccdc136Q3TVA9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Ccdc136Q3TVA9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Ccdc136Q3TVA9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Ccdc136Q3TVA9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Ccdc136Q3TVA9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Ccdc136Q3TVA9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Ccdc136Q3TVA9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Ccdc136Q3TVA9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Ccdc136Q3TVA9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ccdc136Q3TVA9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ccdc136Q3TVA9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ccdc136Q3TVA9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Ccdc136Q3TVA9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Ccdc136Q3TVA9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ccdc136Q3TVA9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ccdc136Q3TVA9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ccdc136Q3TVA9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
Ccdc136Q3TVA9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Ccdc136Q3TVA9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
Ccdc136Q3TVA9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ccdc136Q3TVA9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ccdc136Q3TVA9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ccdc136Q3TVA9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ccdc136Q3TVA9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ccdc136Q3TVA9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms