Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21440Q3TTD8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm21440Q3TTD8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21440Q3TTD8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21440Q3TTD8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21440Q3TTD8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21440Q3TTD8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21440Q3TTD8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms