Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Calr4Q3TQS0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Calr4Q3TQS0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Calr4Q3TQS0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Calr4Q3TQS0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Calr4Q3TQS0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Calr4Q3TQS0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Calr4Q3TQS0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Calr4Q3TQS0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Calr4Q3TQS0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Calr4Q3TQS0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Calr4Q3TQS0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Calr4Q3TQS0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Calr4Q3TQS0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Calr4Q3TQS0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Calr4Q3TQS0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Calr4Q3TQS0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Calr4Q3TQS0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Calr4Q3TQS0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms