Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd300lgQ1ERP8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300lgQ1ERP8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd300lgQ1ERP8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300lgQ1ERP8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms