Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Myo3bQ1EG27 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Myo3bQ1EG27 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Myo3bQ1EG27 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Myo3bQ1EG27 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms