Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8b1Q148W0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp8b1Q148W0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp8b1Q148W0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b1Q148W0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms