Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ccdc162pQ0VG85 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc162pQ0VG85 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc162pQ0VG85 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms