Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Atp2b3Q0VF55 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Atp2b3Q0VF55 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Atp2b3Q0VF55 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Atp2b3Q0VF55 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Atp2b3Q0VF55 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Atp2b3Q0VF55 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Atp2b3Q0VF55 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Atp2b3Q0VF55 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Atp2b3Q0VF55 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Atp2b3Q0VF55 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Atp2b3Q0VF55 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Atp2b3Q0VF55 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Atp2b3Q0VF55 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Atp2b3Q0VF55 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Atp2b3Q0VF55 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Atp2b3Q0VF55 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Atp2b3Q0VF55 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Atp2b3Q0VF55 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Atp2b3Q0VF55 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Atp2b3Q0VF55 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Atp2b3Q0VF55 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40,2 ms