Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne7Q0VE82 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cpne7Q0VE82 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne7Q0VE82 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne7Q0VE82 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms