Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt80Q0VBK2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt80Q0VBK2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt80Q0VBK2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt80Q0VBK2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms