Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prelid2Q0VBB0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prelid2Q0VBB0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prelid2Q0VBB0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prelid2Q0VBB0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prelid2Q0VBB0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms