Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SobpQ0P5V2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SobpQ0P5V2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SobpQ0P5V2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SobpQ0P5V2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SobpQ0P5V2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms