Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700061G19RikQ08EE8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700061G19RikQ08EE8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700061G19RikQ08EE8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700061G19RikQ08EE8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms