Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Hoxc4Q08624 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxc4Q08624 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc4Q08624 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc4Q08624 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms