Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calb2Q08331 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calb2Q08331 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calb2Q08331 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calb2Q08331 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calb2Q08331 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms