Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ebf1Q07802 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ebf1Q07802 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ebf1Q07802 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms