Protein–RNA interactions for Protein: Q05915

Gch1, GTP cyclohydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gch1Q05915 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gch1Q05915 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gch1Q05915 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gch1Q05915 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gch1Q05915 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gch1Q05915 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gch1Q05915 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gch1Q05915 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gch1Q05915 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gch1Q05915 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gch1Q05915 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gch1Q05915 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gch1Q05915 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gch1Q05915 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gch1Q05915 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gch1Q05915 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gch1Q05915 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gch1Q05915 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gch1Q05915 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gch1Q05915 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gch1Q05915 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gch1Q05915 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gch1Q05915 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gch1Q05915 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gch1Q05915 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gch1Q05915 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gch1Q05915 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gch1Q05915 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gch1Q05915 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gch1Q05915 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gch1Q05915 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gch1Q05915 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gch1Q05915 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gch1Q05915 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gch1Q05915 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gch1Q05915 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gch1Q05915 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gch1Q05915 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gch1Q05915 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gch1Q05915 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms