Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox10Q04888 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox10Q04888 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sox10Q04888 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sox10Q04888 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sox10Q04888 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sox10Q04888 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox10Q04888 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox10Q04888 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox10Q04888 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox10Q04888 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Sox10Q04888 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sox10Q04888 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox10Q04888 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sox10Q04888 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms