Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk16Q04735 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk16Q04735 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk16Q04735 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk16Q04735 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk16Q04735 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms