Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk7Q03147 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk7Q03147 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk7Q03147 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk7Q03147 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms