Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col6a2Q02788 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col6a2Q02788 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col6a2Q02788 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms