Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NfiaQ02780 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NfiaQ02780 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NfiaQ02780 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NfiaQ02780 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NfiaQ02780 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NfiaQ02780 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NfiaQ02780 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NfiaQ02780 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NfiaQ02780 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NfiaQ02780 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NfiaQ02780 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NfiaQ02780 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NfiaQ02780 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NfiaQ02780 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NfiaQ02780 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NfiaQ02780 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms