Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EgfrQ01279 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EgfrQ01279 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EgfrQ01279 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EgfrQ01279 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EgfrQ01279 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EgfrQ01279 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EgfrQ01279 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EgfrQ01279 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EgfrQ01279 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EgfrQ01279 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EgfrQ01279 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EgfrQ01279 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EgfrQ01279 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EgfrQ01279 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms