Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab33aP97950 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab33aP97950 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab33aP97950 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab33aP97950 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab33aP97950 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab33aP97950 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab33aP97950 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab33aP97950 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab33aP97950 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab33aP97950 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab33aP97950 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab33aP97950 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab33aP97950 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab33aP97950 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab33aP97950 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab33aP97950 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab33aP97950 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab33aP97950 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab33aP97950 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms