Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp2P97473 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp2P97473 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp2P97473 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tarbp2P97473 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tarbp2P97473 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp2P97473 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp2P97473 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tarbp2P97473 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms