Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Crmp1P97427 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Crmp1P97427 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Crmp1P97427 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Crmp1P97427 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms