Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrp1P97333 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nrp1P97333 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrp1P97333 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nrp1P97333 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nrp1P97333 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nrp1P97333 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nrp1P97333 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nrp1P97333 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nrp1P97333 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nrp1P97333 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrp1P97333 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrp1P97333 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms