Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp2P97299 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp2P97299 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms