Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubg1P83887 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubg1P83887 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubg1P83887 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms