Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otx2P80206 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otx2P80206 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Otx2P80206 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Otx2P80206 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otx2P80206 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otx2P80206 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otx2P80206 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otx2P80206 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otx2P80206 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otx2P80206 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otx2P80206 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms