Protein–RNA interactions for Protein: P70451

Fer, Tyrosine-protein kinase Fer, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FerP70451 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FerP70451 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FerP70451 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FerP70451 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FerP70451 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FerP70451 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FerP70451 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FerP70451 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FerP70451 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FerP70451 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FerP70451 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FerP70451 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FerP70451 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FerP70451 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FerP70451 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FerP70451 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FerP70451 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FerP70451 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FerP70451 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FerP70451 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FerP70451 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FerP70451 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FerP70451 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FerP70451 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FerP70451 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FerP70451 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FerP70451 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FerP70451 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FerP70451 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FerP70451 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FerP70451 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FerP70451 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FerP70451 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FerP70451 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FerP70451 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FerP70451 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FerP70451 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FerP70451 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FerP70451 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FerP70451 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FerP70451 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FerP70451 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FerP70451 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FerP70451 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FerP70451 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FerP70451 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FerP70451 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FerP70451 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FerP70451 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FerP70451 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FerP70451 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FerP70451 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FerP70451 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FerP70451 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FerP70451 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FerP70451 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FerP70451 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FerP70451 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FerP70451 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FerP70451 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FerP70451 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FerP70451 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FerP70451 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FerP70451 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FerP70451 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FerP70451 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FerP70451 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FerP70451 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FerP70451 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FerP70451 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FerP70451 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FerP70451 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FerP70451 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FerP70451 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FerP70451 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FerP70451 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FerP70451 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FerP70451 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FerP70451 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FerP70451 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FerP70451 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FerP70451 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FerP70451 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FerP70451 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FerP70451 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FerP70451 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FerP70451 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FerP70451 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FerP70451 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FerP70451 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FerP70451 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FerP70451 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FerP70451 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FerP70451 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FerP70451 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FerP70451 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FerP70451 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FerP70451 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FerP70451 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FerP70451 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms