Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad50P70388 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad50P70388 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad50P70388 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad50P70388 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad50P70388 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad50P70388 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad50P70388 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad50P70388 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad50P70388 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad50P70388 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad50P70388 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad50P70388 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad50P70388 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad50P70388 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad50P70388 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad50P70388 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad50P70388 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad50P70388 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad50P70388 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rad50P70388 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rad50P70388 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rad50P70388 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rad50P70388 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rad50P70388 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rad50P70388 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rad50P70388 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rad50P70388 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rad50P70388 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad50P70388 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad50P70388 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad50P70388 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad50P70388 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rad50P70388 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rad50P70388 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rad50P70388 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rad50P70388 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rad50P70388 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rad50P70388 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rad50P70388 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rad50P70388 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rad50P70388 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rad50P70388 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rad50P70388 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rad50P70388 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rad50P70388 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rad50P70388 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rad50P70388 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rad50P70388 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rad50P70388 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rad50P70388 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rad50P70388 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rad50P70388 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms