Protein–RNA interactions for Protein: P70325

Tbx4, T-box transcription factor TBX4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx4P70325 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbx4P70325 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbx4P70325 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbx4P70325 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbx4P70325 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbx4P70325 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbx4P70325 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbx4P70325 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbx4P70325 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbx4P70325 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbx4P70325 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbx4P70325 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbx4P70325 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbx4P70325 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbx4P70325 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbx4P70325 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbx4P70325 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbx4P70325 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbx4P70325 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbx4P70325 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbx4P70325 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbx4P70325 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbx4P70325 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbx4P70325 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbx4P70325 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbx4P70325 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbx4P70325 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbx4P70325 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tbx4P70325 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbx4P70325 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbx4P70325 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tbx4P70325 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbx4P70325 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tbx4P70325 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms