Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Traf5P70191 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Traf5P70191 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Traf5P70191 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Traf5P70191 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Traf5P70191 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Traf5P70191 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Traf5P70191 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Traf5P70191 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Traf5P70191 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Traf5P70191 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Traf5P70191 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Traf5P70191 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Traf5P70191 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms