Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actg1P63260 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actg1P63260 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actg1P63260 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Actg1P63260 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actg1P63260 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actg1P63260 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actg1P63260 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actg1P63260 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actg1P63260 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actg1P63260 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actg1P63260 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actg1P63260 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms