Protein–RNA interactions for Protein: P63054

Pcp4, Calmodulin regulator protein PCP4, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4P63054 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcp4P63054 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcp4P63054 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcp4P63054 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcp4P63054 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms