Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2lP62876 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr2lP62876 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2lP62876 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2lP62876 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2lP62876 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2lP62876 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2lP62876 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2lP62876 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2lP62876 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2lP62876 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms