Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f4P62515 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f4P62515 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou3f4P62515 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou3f4P62515 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms