Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd3P62320 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd3P62320 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms