Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SnrpeP62305 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpeP62305 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms