Protein–RNA interactions for Protein: P61963

Dcaf7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf7P61963 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dcaf7P61963 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dcaf7P61963 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dcaf7P61963 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dcaf7P61963 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Dcaf7P61963 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dcaf7P61963 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dcaf7P61963 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dcaf7P61963 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dcaf7P61963 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dcaf7P61963 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dcaf7P61963 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dcaf7P61963 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Dcaf7P61963 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dcaf7P61963 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dcaf7P61963 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dcaf7P61963 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dcaf7P61963 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dcaf7P61963 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dcaf7P61963 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms