Protein–RNA interactions for Protein: P61922

Abat, 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbatP61922 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AbatP61922 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AbatP61922 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AbatP61922 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AbatP61922 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AbatP61922 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AbatP61922 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AbatP61922 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AbatP61922 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AbatP61922 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AbatP61922 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AbatP61922 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AbatP61922 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AbatP61922 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AbatP61922 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AbatP61922 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AbatP61922 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AbatP61922 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AbatP61922 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AbatP61922 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AbatP61922 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AbatP61922 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AbatP61922 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AbatP61922 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AbatP61922 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AbatP61922 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AbatP61922 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AbatP61922 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AbatP61922 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AbatP61922 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AbatP61922 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AbatP61922 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AbatP61922 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AbatP61922 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AbatP61922 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AbatP61922 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AbatP61922 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AbatP61922 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AbatP61922 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AbatP61922 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AbatP61922 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AbatP61922 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AbatP61922 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AbatP61922 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AbatP61922 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AbatP61922 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AbatP61922 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AbatP61922 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AbatP61922 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AbatP61922 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AbatP61922 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AbatP61922 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AbatP61922 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AbatP61922 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AbatP61922 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AbatP61922 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AbatP61922 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AbatP61922 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AbatP61922 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AbatP61922 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AbatP61922 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AbatP61922 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AbatP61922 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AbatP61922 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AbatP61922 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AbatP61922 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AbatP61922 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AbatP61922 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AbatP61922 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AbatP61922 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AbatP61922 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AbatP61922 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AbatP61922 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AbatP61922 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AbatP61922 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AbatP61922 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AbatP61922 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AbatP61922 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AbatP61922 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbatP61922 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbatP61922 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbatP61922 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbatP61922 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AbatP61922 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbatP61922 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbatP61922 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbatP61922 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AbatP61922 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AbatP61922 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AbatP61922 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AbatP61922 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AbatP61922 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AbatP61922 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AbatP61922 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AbatP61922 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AbatP61922 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AbatP61922 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AbatP61922 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AbatP61922 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AbatP61922 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms