Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2kP61087 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ube2kP61087 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2kP61087 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2kP61087 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2kP61087 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2kP61087 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2kP61087 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2kP61087 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2kP61087 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2kP61087 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2kP61087 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2kP61087 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2kP61087 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2kP61087 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2kP61087 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms