Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcbp1P60335 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcbp1P60335 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcbp1P60335 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcbp1P60335 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcbp1P60335 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcbp1P60335 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcbp1P60335 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcbp1P60335 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcbp1P60335 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcbp1P60335 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcbp1P60335 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcbp1P60335 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcbp1P60335 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Pcbp1P60335 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcbp1P60335 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms