Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdo1P60334 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdo1P60334 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdo1P60334 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdo1P60334 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms