Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr3bP59470 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr3bP59470 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr3bP59470 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms