Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdf1P59326 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdf1P59326 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ythdf1P59326 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdf1P59326 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ythdf1P59326 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ythdf1P59326 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ythdf1P59326 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ythdf1P59326 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ythdf1P59326 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ythdf1P59326 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms